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perl脚本如下:
die"perl$0<in><out>"unless(@ARGV==2);useBio::SeqIO;useBio::Seq;useBio::Tools::SeqStats;useBio::Tools::pICalculator;useData::Dumper;#读入序列my$in=Bio::SeqIO->new(-file=>"$ARGV[0]",-format=>'Fasta');openOUT,">$ARGV[1]"ordie"$!";printOUT"#ID\tlength\tMV(Da)\tpI\n";my$calc=Bio::Tools::pICalculator->new(-places=>2,-pKset=>'EMBOSS');#逐条读取序列while(my$seq=$in->next_seq()){my($id,$sequence,$desc)=($seq->id,$seq->seq,$seq->desc);my$weight=Bio::Tools::SeqStats->get_mol_wt($seq);$calc->seq($seq);my$iep=$calc->iep;printOUTsprintf("%s\t%s\t%s\t%s\n",$seq->id,$seq->length,"$weight->[0]",$iep);}$in->close();close(OUT);
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