如何分析KEGG Drug 数据库

如何分析KEGG Drug 数据库

今天就跟大家聊聊有关如何分析KEGG Drug 数据库，可能很多人都不太了解，为了让大家更加了解，小编给大家总结了以下内容，希望大家根据这篇文章可以有所收获。

kegg drug 数据库是一个药物相关信息的综合数据库，包括了在日本，美国，欧洲上市的的药物。所有在日本上市的药物，不论处方药还是非处方药，包括天然药物和中药，都会在Drug 数据中有对应的记录；对于在美国和欧洲上市的药物， 只有一部分处方药的信息在drug 数据库中有记录。

根据化学结果和化学组分的不同，将药物进行区分 ，酶中药物 用D number 进行标识，比如 D014441 ， 是一种作用于慢性粒细胞白血病的药物。对于每种药物，记录了其通用名，化学结构，靶标基因，相关的代谢酶，转运蛋白等各种信息，以D014441 为例，来详细看下。

在结构相似性和功能相似性的基础上，建立了KEGG DGROUP 数据库，对药物进行了分类，每个group 用DG 编号开头。在DGROUP 数据库中，有两种类型的group：

1. 第一种下面只包含对应的药物，这些药物的化学结构相近， 比如DG00710包含D08066和 D01441 两种药物

2. 第二种group还会包含下一级的group,这种其实是按照功能，分成了不同的层级，比如DG01918 同时包含了药物D10223和group DG01917;

除了KEGG DGROUP 数据库，brite 数据库也有药物的分类信息，但是分类的标准特别多。

很多的新药，其实只是在已有药物的基础上，保留核心的化学结构，其他基团稍作变化而成的，了解这种化学结构的变化，可以为我们在药物开发领域提供一定的参考。所以kegg 专门在pathway 数据库中，将各种药物化学结构的转变绘制了对应的通路图，叫做Structure map , 所有是Structure map组成了pathway 数据库中的一大类别，叫做 Drug Development。

map07011 对应的图片如下

1. drug是药物相关信息的综合性数据库，涵盖了所有在日本上市的药物以及部分在美国和欧洲上市的处方药；
2. 根据化学结构的不同，对每种药物进行区分，用D Number 来唯一标识每种药物，在数据库中记录了药物的化学结构，靶标基因，代谢相关的酶等基本信息；
3. 对于药物的分类，KEGG GROUP 数据库根据结构和功能的相似性对药物进行分类，brite数据库则提供了更加多的分类标准；
4. 关于不同药物间化学结构的改变，在pathways数据库中专门有一个叫做Drug Development的类别来进行记录；

看完上述内容，你们对如何分析KEGG Drug 数据库有进一步的了解吗？如果还想了解更多知识或者相关内容，请关注恰卡编程网行业资讯频道，感谢大家的支持。