iTOL怎么为进化树外层添加圆环

iTOL怎么为进化树外层添加圆环

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首先准备好进化树。

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然后准备注释文件,其格式如下:

DATASET_COLORSTRIP#linesstartingwithahasharecommentsandignoredduringparsing#selecttheseparatorwhichisusedtodelimitthedatabelow(TAB,SPACEorCOMMA).Thisseparatormustbeusedthroughtthisfile(exceptintheSEPARATORline,whichusesspace).#SEPARATORTABSEPARATORSPACE#SEPARATORCOMMA#labelisusedinthelegendtable(canbechangedlater)DATASET_LABELcolor_strip2#datasetcolor(canbechangedlater)COLOR#ff0000#optionalsettings#allotheroptionalsettingscanbesetorchangedlaterinthewebinterface(under'Datasets'tab)#maximumwidthSTRIP_WIDTH25#leftmargin,usedtoincrease/decreasethespacingtothenextdataset.Canbenegative,causingdatasetstooverlap.MARGIN0#borderwidth;ifsetabove0,ablackborderofspecifiedwidth(inpixels)willbedrawnaroundthecolorstripBORDER_WIDTH1BORDER_COLOR#000#showinternalvalues;ifset,valuesassociatedtointernalnodeswillbedisplayedevenifthesenodesarenotcollapsed.Itcouldcauseoverlappinginthedatasetdisplay.SHOW_INTERNAL0#Incoloredstripcharts,eachIDisassociatedtoacolor.Colorcanbespecifiedinhexadecimal,RGBorRGBAnotation#InternaltreenodescanbespecifiedusingIDsdirectly,orusingthe'lastcommonancestor'methoddescribediniTOLhelppages#Actualdatafollowsafterthe"DATA"keywordDATA#ID1value1#ID2value2160232#efff22COL#efff2213773#efff22COL#efff2256636#efff22COL#efff22111955#efff22COL#efff222287#efff22COL#efff2250339#efff22COL#efff222303#efff22COL#efff222234#efff22COL#efff22

DATA之前的部分都是格式声明,照抄即可。之后就是添加圆环数据,数据分两列,第一列为原始标签,第二列是圆环对应颜色,之间以Ta空格分隔。准备好数据后就可以加到进化树中了。

以上就是关于“iTOL怎么为进化树外层添加圆环”这篇文章的内容,相信大家都有了一定的了解,希望小编分享的内容对大家有帮助,若想了解更多相关的知识内容,请关注恰卡编程网行业资讯频道。

发布于 2022-03-19 21:14:03
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